90%的尖锐湿疣都是感染HPV6和HPV11引起。有时尖锐湿疣也存在低危型和高危型的HPV混合感染。
有数据显示31%的尖锐湿疣皮损中,存在着高危型的HPV,比如HPV16、HPV18、HPV52和HPV56型。HPV已经有一百多个亚型,其中有四十多种可以感染肛门生殖器区域。HPV感染在人群当中很普遍,不同亚型与不同的疾病相关,大多数生殖器的HPV感染,具有自愈的倾向,既能够自行清除,也不会引起相关的疾病。
当HPV感染不能清除时,可能会发展为尖锐湿疣等疾病,有部分的HPV与发生癌症的风险增高有一定关系,如宫颈癌等,称之为高危型的HPV。